ASCO: IA

Imagem ômica espacial de tecido canceroso humano

Entre as grandes leituras de ensaios clínicos na ASCO, um novo projeto de pesquisa fez sua estreia oficial com o ambicioso objetivo de mapear as interações das células cancerígenas com seu ambiente em "resolução próxima de uma única célula".

O projeto – apelidado de MOSAIC (Multi Omic Spatial Atlas in Cancer) – reúne uma série de organizações acadêmicas de pesquisa em câncer, bem como a empresa de inteligência artificial Owkin, especializada em modelos de aprendizado de máquina usados ​​para encontrar novos biomarcadores e alvos terapêuticos de amostras de pacientes e empresa de biologia espacial NanoString.

O MOSAIC está começando a vida com US$ 50 milhões em financiamento de Owkin e usará uma técnica conhecida como 'ômica espacial', que combina sequenciamento de genes com tecnologias de imagem para analisar RNA e proteínas não apenas por sua presença ou quantidade, mas também onde eles estão fisicamente localizadas nas células e no microambiente que elas habitam.

De acordo com o consórcio – que reúne a Universidade de Pittsburgh, Gustave Roussy, Lausanne University Hospital, Uniklinikum Erlangen/Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg e Charité-Universitätsmedizin Berlin – o projeto de pesquisa é 100 vezes maior do que qualquer ômica espacial existente conjunto de dados. Espera-se que mais organizações se juntem ao esforço nos próximos meses.

Os dados serão gerados a partir de cerca de 7.000 pacientes com vários tipos de câncer, de acordo com os parceiros, e podem ajudar os pesquisadores a entender melhor o câncer em nível molecular, caracterizar diferentes formas de câncer com mais precisão e identificar novos alvos que podem eventualmente levar a novas e melhores terapias. . Os projetos atuais normalmente envolvem menos de 50 pacientes.

“Acredito que a ômica espacial combinada com a IA é o catalisador para impulsionar a próxima revolução na pesquisa do câncer”, disse o executivo-chefe da Owkin, Thomas Clozel, em um post no LinkedIn. "A combinação de genes com tecidos e tumor com microambiente permite descobertas sobre os dados dos pacientes que os estudos de linhas celulares perderiam."

Um dos principais objetivos do consórcio nos primeiros dias será desenvolver padrões para governar como os dados ômicos espaciais devem ser analisados ​​e comparados, na esperança de criar um manual comum para grupos de pesquisa que operam nesta área. A esperança é que, com o tempo, os dados padronizados e os métodos de geração e análise de dados se tornem acessíveis à comunidade biomédica global, para acelerar a pesquisa nessa área.

O MOSAIC se concentrará inicialmente em cânceres com necessidades médicas não atendidas, incluindo câncer de pulmão de células não pequenas, câncer de mama triplo negativo, linfoma difuso de grandes células B, câncer de ovário, glioblastoma, mesotelioma e câncer de bexiga, disseram os parceiros.